Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms