Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms