Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN10P78369 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN10P78369 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN10P78369 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN10P78369 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN10P78369 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN10P78369 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms