Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFM1P61960 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms