Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms