Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL3P58215 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms