Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AIF1P55008 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AIF1P55008 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AIF1P55008 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AIF1P55008 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AIF1P55008 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AIF1P55008 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AIF1P55008 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AIF1P55008 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AIF1P55008 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AIF1P55008 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms