Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOSBP53539 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOSBP53539 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOSBP53539 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSBP53539 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSBP53539 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms