Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK4P51957 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK4P51957 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK4P51957 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK4P51957 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NEK4P51957 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEK4P51957 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEK4P51957 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEK4P51957 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK4P51957 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK4P51957 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK4P51957 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK4P51957 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK4P51957 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK4P51957 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK4P51957 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK4P51957 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms