Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRXP46100 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRXP46100 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRXP46100 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRXP46100 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRXP46100 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRXP46100 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms