Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCAMP43121 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCAMP43121 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCAMP43121 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCAMP43121 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms