Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms