Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYH11P35749 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYH11P35749 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYH11P35749 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYH11P35749 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH11P35749 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms