Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX2P32243 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX2P32243 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX2P32243 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX2P32243 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms