Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPOP30536 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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