Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms