Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTGFP29279 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTGFP29279 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTGFP29279 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTGFP29279 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTGFP29279 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms