Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E2P29084 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms