Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms