Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms