Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA1P25391 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA1P25391 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms