Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms