Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYF6P23409 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYF6P23409 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYF6P23409 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYF6P23409 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYF6P23409 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYF6P23409 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYF6P23409 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms