Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms