Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms