Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN3P07498 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN3P07498 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms