Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTMAP06454 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTMAP06454 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTMAP06454 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTMAP06454 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTMAP06454 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTMAP06454 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTMAP06454 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms