Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN1P04843 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPN1P04843 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPN1P04843 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPN1P04843 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN1P04843 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN1P04843 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN1P04843 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN1P04843 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN1P04843 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN1P04843 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms