Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL2A1P02458 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms