Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NUDT3O95989 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NUDT3O95989 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms