Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPAN13O95857 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPAN13O95857 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPAN13O95857 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPAN13O95857 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPAN13O95857 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPAN13O95857 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPAN13O95857 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPAN13O95857 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms