Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFL1O94874 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFL1O94874 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UFL1O94874 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFL1O94874 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFL1O94874 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFL1O94874 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFL1O94874 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFL1O94874 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UFL1O94874 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UFL1O94874 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UFL1O94874 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFL1O94874 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFL1O94874 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFL1O94874 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UFL1O94874 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UFL1O94874 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms