Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms