Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms