Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms