Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms