Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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