Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms