Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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