Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCER2I3L3R5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms