Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E9PBE3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E9PBE3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E9PBE3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E9PBE3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E9PBE3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E9PBE3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E9PBE3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E9PBE3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E9PBE3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E9PBE3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E9PBE3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms