Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms