Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN2A8MW95 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms