Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms