Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms