Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TARSL2A2RTX5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TARSL2A2RTX5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms