Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms