Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms