Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 CYP4A11-203ENST00000371905 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC084876.2-201ENST00000624844 1709 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 OR4P4-202ENST00000641760 2086 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 CCDC15-201ENST00000344762 3893 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 IARS2P1-201ENST00000508226 3173 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 TNS1-202ENST00000310858 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 BTN2A2-202ENST00000356709 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 PABPC1P12-201ENST00000428454 2175 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 VSIG4-204ENST00000455586 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ARMC8-215ENST00000471453 2910 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AL591222.1-201ENST00000568063 3844 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 OR2B11-203ENST00000641527 4545 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 PHACTR2-AS1-201ENST00000450575 1699 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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C4orf17Q53FE4 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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C4orf17Q53FE4 AL138957.1-201ENST00000435156 342 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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C4orf17Q53FE4 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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C4orf17Q53FE4 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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C4orf17Q53FE4 GAPDHP50-201ENST00000464421 993 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC092958.1-202ENST00000485006 424 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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C4orf17Q53FE4 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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C4orf17Q53FE4 PSAT1P1-201ENST00000518968 1106 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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C4orf17Q53FE4 STXBP6-204ENST00000546511 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 LINC02385-201ENST00000547554 428 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 TBX18-AS1-208ENST00000591225 762 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 IGKV3OR2-5-201ENST00000605851 281 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 U1.40-201ENST00000610976 164 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ZNHIT3-204ENST00000617429 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AC092329.4-205ENST00000638822 574 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ZNF410-225ENST00000639051 936 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 ZNF714-201ENST00000425625 2562 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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