Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 TXLNG-201ENST00000380122 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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